Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem50aQ9CXL1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms