Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnih4Q9CX13 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms