Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx28Q9CWT6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms