Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfdn1Q9CWM4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
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