Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BccipQ9CWI3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms