Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smurf1Q9CUN6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms