Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms