Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029F12RikQ9CRB4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms