Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ska2Q9CR46 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms