Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmd9Q9CR00 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmd9Q9CR00 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms