Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3kQ9CQZ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms