Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nicn1Q9CQM0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nicn1Q9CQM0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.5 ms