Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms