Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmc1Q9CPZ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmc1Q9CPZ8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms