Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT5

Nop16, Nucleolar protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop16Q9CPT5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nop16Q9CPT5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop16Q9CPT5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms