Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt23Q99PS0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms