Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rad54l2Q99NG0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad54l2Q99NG0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rad54l2Q99NG0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms