Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clint1Q99KN9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clint1Q99KN9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms