Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddb2Q99J79 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms