Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpe65Q91ZQ5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms