Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc49Q91YK0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms