Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chrna2Q91X60 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna2Q91X60 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms