Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usb1Q91W78 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms