Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd3Q91W18 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms