Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfxn3Q91V61 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms