Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfxapQ8VCG9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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