Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc12Q8K5B8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms