Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z5

Sf3a1, Splicing factor 3A subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a1Q8K4Z5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3a1Q8K4Z5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3a1Q8K4Z5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms