Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Colec12Q8K4Q8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Colec12Q8K4Q8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms