Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abca9Q8K449 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abca9Q8K449 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abca9Q8K449 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abca9Q8K449 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abca9Q8K449 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca9Q8K449 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca9Q8K449 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Abca9Q8K449 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms