Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lrrtm1Q8K377 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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