Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf39Q8K2Z2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms