Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stn1Q8K2X3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms