Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fbxo18Q8K2I9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fbxo18Q8K2I9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fbxo18Q8K2I9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fbxo18Q8K2I9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fbxo18Q8K2I9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms