Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Cmc2Q8K199 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmc2Q8K199 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms