Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SbsnQ8CIT9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms