Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ercc8Q8CFD5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ercc8Q8CFD5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Ercc8Q8CFD5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ercc8Q8CFD5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ercc8Q8CFD5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ercc8Q8CFD5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc8Q8CFD5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ercc8Q8CFD5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ercc8Q8CFD5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ercc8Q8CFD5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ercc8Q8CFD5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ercc8Q8CFD5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ercc8Q8CFD5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ercc8Q8CFD5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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