Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nkiras1Q8CEC5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras1Q8CEC5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms