Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms