Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek11Q8C0Q4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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