Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Atg16l1Q8C0J2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Atg16l1Q8C0J2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Atg16l1Q8C0J2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Atg16l1Q8C0J2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg16l1Q8C0J2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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