Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tyw3Q8BSA9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tyw3Q8BSA9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tyw3Q8BSA9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tyw3Q8BSA9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tyw3Q8BSA9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tyw3Q8BSA9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tyw3Q8BSA9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tyw3Q8BSA9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tyw3Q8BSA9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tyw3Q8BSA9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms