Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3gap2Q8BMG7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms