Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gpc2Q8BKV1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms