Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Vipas39Q8BGQ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Vipas39Q8BGQ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vipas39Q8BGQ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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