Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms