Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc50Q810U5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms