Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms