Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms