Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna12Q80SS5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms